2021.02.05
學(xué)術(shù)界“大牛”Nature近日發(fā)表綜述,遴選出2021年值得關(guān)注的重點(diǎn)技術(shù),MALDI離子源應(yīng)用于臨床生物組織成像分析入選。
這說明質(zhì)譜成像技術(shù)的發(fā)展,已越來越接近應(yīng)用于臨床分析的能力要求。而一旦質(zhì)譜技術(shù)達(dá)到了這一要求,將面臨一個(gè)全新的藍(lán)海市場(chǎng)----生物病理/毒理原位分析。
為什么要說接近,而不是達(dá)到?咱們要看當(dāng)前臨床病理分析的一些需求。
當(dāng)前,臨床病理分析主要依靠免疫組化手段,即使用免疫標(biāo)記技術(shù),抓取病理組織的標(biāo)志物,從而進(jìn)行病理分析。
MALDI離子源和ESI離子源于2002年同時(shí)獲得了諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),獲獎(jiǎng)的核心原因是這兩種離子源為質(zhì)譜技術(shù)應(yīng)用于生命科學(xué)大分子分析提供了手段。
但在其后的發(fā)展中,MALDI離子源因?yàn)楦鞣N原因,在蛋白組學(xué)領(lǐng)域被邊緣化,其分析大分子的能力主要應(yīng)用于微生物指紋數(shù)據(jù)建設(shè),即我們常說的微生物質(zhì)譜;或者應(yīng)用于核酸位點(diǎn)分析(SNP),即現(xiàn)在常說的PCR-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)。基于MALDI離子源的成像技術(shù)的出現(xiàn),大有請(qǐng)MALDI-TOF MS重回蛋白組學(xué)研究領(lǐng)域的趨勢(shì)。ESI離子源則直接奔向了代謝分析,在蛋白組學(xué)領(lǐng)域其亦只能進(jìn)行大分子的碎片分析,且效率堪憂。
雖然MALDI經(jīng)常被認(rèn)為可分析m/z超過幾十萬的分子,但事實(shí)上,限于MALDI-TOF MS在工程化等方面的原因,一般我們所見到的國(guó)外企業(yè)所謂的高端MALDI-TOF MS,只能較有效地分析m/z小于20000的分子,再往上,無論是靈敏度還是質(zhì)量分辨率,都捉襟見肘。而當(dāng)前病理分析中已經(jīng)寫進(jìn)共識(shí)或指南的標(biāo)志物集中于大蛋白分子,豐度較低,因此在性能上,當(dāng)前這些質(zhì)譜儀無法達(dá)標(biāo)。
成像質(zhì)譜技術(shù)需要在極小的視覺范圍(即樣本范圍)進(jìn)行快速的成份和含量分析,因而對(duì)質(zhì)譜儀的靈敏度提出了較高要求。
舉個(gè)粟子,當(dāng)前商品化MALDI質(zhì)譜儀的最高空間分辨率是10微米,為達(dá)到這樣的空間分辨能力,實(shí)際分析的樣本面積甚至更小,所獲得的樣本量當(dāng)然也是非常稀少,質(zhì)譜儀在非常極端的分析環(huán)境下努力地進(jìn)行樣本離子化工作,這對(duì)儀器的靈敏度提出了極高的要求。
再舉個(gè)粟子,當(dāng)前商品化MALDI質(zhì)譜儀的成像速率,國(guó)外企業(yè)最高據(jù)稱達(dá)到了50像素/秒(在這項(xiàng)指標(biāo)上,國(guó)內(nèi)企業(yè)還是蠻爭(zhēng)光的,咱們后面再說),即每秒要分析50個(gè)只有小于10微米面積的樣本,這同樣對(duì)質(zhì)譜儀的靈敏度提出了嚴(yán)苛的要求。
成像質(zhì)譜儀的幾個(gè)關(guān)鍵性能,靈敏度、成像空間分辨率和成像速率,這三個(gè)參數(shù)互為反比,互相制約,而要同時(shí)提升這三個(gè)參數(shù),核心就在于提升質(zhì)譜儀的靈敏度。而要真正介入生命科學(xué)分析,還要提升分析生物大分子的靈敏度能力。但提升一臺(tái)質(zhì)譜儀的靈敏度,何其難也,這是質(zhì)譜儀技術(shù)的世界級(jí)難題!
MALDI應(yīng)用于臨床組織成像的關(guān)鍵要求
MALDI成像質(zhì)譜技術(shù)要快速與臨床需求對(duì)接,就需要能夠直接對(duì)蛋白大分子進(jìn)行成像。這就說到了當(dāng)前質(zhì)譜成像技術(shù)的一大痛點(diǎn),即質(zhì)譜儀在分析高質(zhì)荷比分子時(shí),無論電離效率、靈敏度以及分辨率,都是幾何級(jí)數(shù)的衰減,所以,看!不!到!
于是,當(dāng)前質(zhì)譜成像技術(shù)應(yīng)用于臨床組織分析,主要是在代謝組學(xué)圈子里打轉(zhuǎn),比如下圖:
圖一:胃癌癌變及癌旁組織質(zhì)譜成像圖,由融智生物QuanIMAGE 實(shí)現(xiàn)
在m/z=784.9時(shí),發(fā)現(xiàn)在癌變組織中有高表達(dá)(右),在癌旁組織中,隨著離癌變組織距離越遠(yuǎn),其表達(dá)快速下降(左)。
截至目前,組織成像技術(shù)應(yīng)用于癌癥組織標(biāo)志物研究已經(jīng)興起(悄悄說一聲,質(zhì)譜成像技術(shù)會(huì)很快成為論文大戶),但如上圖一樣,限于質(zhì)譜儀的性能,只能進(jìn)行代謝分析。雖然論文已經(jīng)有了不少,但真正能夠走入臨床,還需要大量的標(biāo)志物篩找、臨床驗(yàn)證等工作,有些遙不可及。
有需求,才有研發(fā)動(dòng)力嘛!來看看咱們國(guó)產(chǎn)質(zhì)譜儀的大分子成像能力(不服來戰(zhàn))!
圖二:大蛋白分子成像,由融智生物QuanIMAGE 實(shí)現(xiàn)
圖三:豬肝臟血紅蛋白直接成像,由融智生物QuanIMAGE 實(shí)現(xiàn)
臨床分析要講效率,尤其很多分析是在病人身體打開,取樣化驗(yàn)等待手術(shù)指導(dǎo)的情況下進(jìn)行的。質(zhì)譜成像技術(shù),說白了就是高密度進(jìn)行大規(guī)模的樣本分析,即便小到1平方毫米的樣本,按10微米空間分辨分析計(jì)算,大約也要分析10萬個(gè)樣本,50像素/秒的速率,也需要33分鐘。如此效率,如何應(yīng)用于臨床?
咱們?cè)賮砜纯磭?guó)產(chǎn)質(zhì)譜儀的成像速率能力(不服來戰(zhàn))!
截至目前,融智生物的QuanIMAGE系列商品化質(zhì)譜儀已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了在10微米空間分辨率下,大于300像素/秒的成像速率,1平方毫米的樣本按10微米空間分辨分析計(jì)算,所需時(shí)間小于6分鐘!成像速度與上面提到的國(guó)外企業(yè)相比,提升了5倍之多!
圖四:胰臟胰島細(xì)胞單激光/單細(xì)胞成像,由融智生物QuanIMAGE實(shí)現(xiàn)
Nature為我們提出了應(yīng)當(dāng)關(guān)注的技術(shù),但這些技術(shù)真正發(fā)展起來應(yīng)用于臨床問題的解決,還需要科研人員大量的辛勤工作。在這方面,我們中國(guó)企業(yè)扎實(shí)地做出了不少成績(jī)。通過一系列核心技術(shù),極大地提升了MALDI-TOF MS分析大分子的靈敏度和分辨率(中國(guó)分析測(cè)試協(xié)會(huì)2019年驗(yàn)證結(jié)果,10fmol信噪比大于200,BSA),因而能夠在條件嚴(yán)苛的成像質(zhì)譜技術(shù)中,實(shí)現(xiàn)對(duì)m/z大于20000的蛋白分子進(jìn)行直接成像,能夠?qū)崿F(xiàn)大于300像素/秒的成像速率,為質(zhì)譜成像技術(shù)真正能夠走入臨床應(yīng)用,做好了科學(xué)儀器端的基礎(chǔ)工作。臨床病理分析專家,你們感興趣Nature提出的關(guān)注方向嗎?